rosetta是一套用于模拟大分子结构的综合软件;该软件最早与1998年用FORTRAN编写,用于对小蛋白进行abinitio预测,现在已经使用“C++”重写,作为一种灵活、多用途的应用,它包括蛋白质和核酸的结构预测、设计和重塑工具。
Rosetta最初是一个结构预测工具,在 CASP 社区范围内的盲预测训练中一直表现出色。它已经成长为提供多种有效的采样算法来探索主链、侧链和序列空间,其优点已经推广到包括 RNA-puzzles 和 CAPRI 在内的更多社区范围的练习中。罗塞塔拥有广泛测试的能量评分功能,包含从折叠到对接到设计的无与伦比的应用范围。
Rosetta的web服务器已经运行了数十亿的结构预测和蛋白质设计模拟,还有数十亿甚至数万亿运行在超级计算机集群上。它提供了多种数据预处理功能,如决策表补齐、决策表离散化等及其算法,同时提供了粗糙集中常见的约简和规则的获取算法,支持从数据预处理到预测和分析规则的全过程,是一个很好的粗糙集理论软件和实验平台。
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