1、增施有机肥。施用有机肥，特别是施用腐熟的有机肥，可降低果实中的硝酸盐含量，能够满足蕃茄对微量元素的需求，充分发挥大量元素氮磷钾的吸收利用率，提高产量和品质。
2、施用长效化肥。蕃茄与其他作物不同，生长期对氮的吸收一直较大，而一般氮肥施用不当会发生淋溶、挥发等降低利用率。可施用涂层尿素、长效碳铵、控制缓释肥等化肥，可避免浪费，提高利用率，减少用肥 量，从而降低对蕃茄的硝酸盐污染。此外，尽量不用硝酸盐化肥。
3、生物肥和化肥混用。番茄长期施用化肥，使微生物大大减少，因此，有机质的消化、分解受到阻碍，营养元素易流失，降低了土壤资源的利用率。目前市场上有许多含有多种氨基酸、微量元素及植物化学成分和微生物代谢物的微生物肥料，具有很强的作物综合生化调控能力和迅速补充养分的功能，这些肥料与化肥混用大大提高化肥利用率，增强土壤有机质和微生物的活性，提高土壤的可持续供给，并且对降低蕃茄果实硝酸盐含量也有显著作用。
4、基肥、追肥、叶面肥相结合。为保证蕃茄生长发育对营养的吸收利用，施用基肥既可提高地力，又可供应苗期需求。适时追肥能有效提高肥料利用率。合理喷施叶面肥主要是喷施微量元素肥料，能满足蕃茄对微量元素的需求。
5、配方施肥。根据土壤原有的营养元素含量，蕃茄生长发育的需要量，按比例增施肥料。配方施肥既能合理调配各种元素用量，提高肥料利用率，保证蕃茄丰产丰收，又不会降低蕃茄果实硝酸盐含量起到显著作用。
6、注意事项：以温调肥：早春温度低，土壤养分供应慢，前期追肥要跟上，5月份以后减少氮肥追肥，增加钾肥的使用。初秋温度高，*壤有机养分供应能力强，以控为主，不要追肥。
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